El Baix Empordà es una comarca de una gran riqueza natural. Su situación y constitución permiten que en ella sobrevivan una serie de espacios característicos de las zonas mediterráneas con tendencia a desaparecer. Al objeto de protegerlos, las áreas más frágiles han pasado a formar parte de la categoría de protección PEIN (Plan de Espacios de Interés Natural). La superficie total protegida suma 23.478 ha, frente a las 70.050 ha totales de la comarca.

Estos espacios protegidos son:
- El Montgrí
- Las islas Medes
- Los humedales del Baix Empordà
- Les Gavarres
- Las montañas de Begur
- El macizo de Cadiretes

La visita de estos espacios representa un compromiso de salvaguardia y protección; por este motivo, le rogamos que extreme las precauciones al objeto de no alterar el medio natural del que está disfrutando.